讀取包含兩列的文件並使用它們更改文件名

我有一個包含兩列的文本文件，一列代表目前文件名，另一列代表我想要作為文件最終名稱的名稱。文本文件是這樣的：

JALAZR010000001.1  -  CM040670.1
JALBAP010000001.1  -  CM040694.1
JALBBH010000001.1  -  CM040712.1
JALBAZ010000001.1  -  CM040704.1
JALBBR010000001.1  -  CM040722.1
JALBBU010000001.1  -  CM040725.1
JALAZL010000001.1  -  CM040664.1
JALBAE010000001.1  -  CM040680.1

該文件位於：

Genomic_data/Mito/CDS/Fungi/JALAZR010000001.1.gb

我試過類似的東西：

awk -F" - " '{print $1, $2}' filename.txt | mv Genomic_data/Mito/CDS/Fungi/{$1}.gb  Genomic_data/Mito/CDS/Fungi/{$2}.gb

但我不是一個經驗豐富的 bash 程序員，所以我非常感謝任何關於如何將兩個 awk 輸出傳遞給 mv 程序的提示（一旦我做不到）。預期的輸出將類似於：

Genomic_data/Mito/CDS/Fungi/CM040670.1.gb

謝謝你的時間。

PS - 任何其他替代範例也會很棒。

您可以mv從 awk 本身執行：

awk -F" - " '{ system("mv "$1" "$2) }' filename.txt

你也可以在沒有 awk 的情況下做到這一點：

while read N1 SEP N2; do mv ${N1} ${N2}; done < filename.txt

這是我的版本，其中 bash 讀取您準備好的文件並建構mv命令（包括路徑前綴）。該腳本假定具有舊/新文件名的輸入文件名為“infile”，但可以輕鬆更改：

#!/usr/bin/env bash

my_input_file='infile'
rename_path="Genomic_data/Mito/CDS/Fungi"

while read -r old_fname discard new_fname
do
  mv "${rename_path}/${old_fname}.gb" "${rename_path}/${new_fname}.gb"
done < "${my_input_file}"

該read操作在空白處拆分輸入文件的行，從而形成三個欄位，每個欄位寫入相應的變數。它將-輸入文件的中間欄位儲存到一個名為discard（從未使用過）的變數中，因為它不是文件重命名操作的一部分。

如果您想執行測試版本，只需將該mv行以開頭，echo 它只會列印mv命令。

引用自：https://unix.stackexchange.com/questions/713482