Bash
如何在 mac 終端中為文件夾中的多個文件執行相同的命令?
如何在 mac 終端中為文件夾中的多個文件執行相同的命令?文件命名為
24538_7#1.fq
、24538_7#2.fq
、24538_7#3.fq
等24538_7#4.fq
。命令是:
sed -n '\|@.*/1|{N;N;N;p;}' 24538_7#2.fq > 24538_7#2_paired1.fq
sed -n '\|@.*/2|{N;N;N;p;}' 24538_7#2.fq > 24538_7#2_paired2.fq
由於文件名涉及計數器,因此顯然需要更改文件名。
我試圖編寫命令,但我在重命名文件時遇到了困難。我對命令的努力如下:
for file in 24538_7#*.fq; do sed -n '\|@.*/1|{N;N;N;p;}' "$file" > "${file/fq/fq}"; done
(PS-我使用MacOS)
假設所有文件的名稱都相似,您可以使用
for file in 24538_7#*.fq; do sed -n '\|@.*/1|{N;N;N;p;}' "$file" > "${file%.fq}_paired1.fq" sed -n '\|@.*/2|{N;N;N;p;}' "$file" > "${file%.fq}_paired2.fq" done
或(以您已經嘗試過的內容為基礎)
for file in 24538_7#*.fq; do sed -n '\|@.*/1|{N;N;N;p;}' "$file" > "${file/.fq/_paired1.fq}" sed -n '\|@.*/2|{N;N;N;p;}' "$file" > "${file/.fq/_paired2.fq}" done
警告:這僅適用於您的特定情況和特定文件名。