帶有 grep 和空格的 for 循環

嘗試同時使用 for 循環和 grep 時，我似乎對空格有點問題。空格很重要，因為例如，我想匹配“k117_19650”，而不是“k117_196509”。幫助將不勝感激！

for i in 'k117_19650 ' 'k117_460555 ';do
   grep -A1 $i final.contigs.fa >> gene.fa
done

您面臨的問題與您對 shell 變數的使用有關。特別是在使用包含“非標準”字元（例如空格）的變數時，請始終在使用它們時引用您的變數，請參見此處的討論：

• 忘記在 bash/POSIX shell 中引用變數的安全隱患
• 為什麼我的 shell 腳本會因空格或其他特殊字元而窒息？ （這兩個根據 Stéphane Chazelas 的建議）
• 在 stackoverflow或這裡。

在你的情況下：

grep -A1 -- "$i" final.contigs.fa >> gene.fa

應該可以解決問題（這裡還添加一個--以防止以$i開頭的值-）。

引用自：https://unix.stackexchange.com/questions/560817