Grep 沒有用空格檢索字元串

我在一個文件中有一系列標題，其名稱如下：

grep ">scaffold_3" DM_v6.1_unanchoredScaffolds.fasta 
>scaffold_3
>scaffold_303
>scaffold_31
>scaffold_34
>scaffold_36
>scaffold_37
>scaffold_39
>scaffold_33
>scaffold_300

我只想選擇第一個，所以我嘗試了：

$ grep ">scaffold_3 " file.fasta 
$
$ grep ">scaffold_3[[:blank:]]" file.fasta 
$
$ grep ">scaffold_3\t" file.fasta 
$
$ grep ">scaffold_3\ " file.fasta 
$
$ grep ">scaffold_3 " file.fasta 
$
$ grep ">scaffold_3[[:space:]]" file.fasta 
$
$ grep ">scaffold_3$" file.fasta 
>scaffold_3

鑑於名稱後面的字元可能是空格、製表符、換行符（也可能來自 Windows）並且[[:space:]]不起作用，我如何才能獲得確切的名稱而不是同義詞？

謝謝

如果您知道文本後沒有空格，那就grep ">scaffold_3$"對了。

或者更確切地說使用單引號，因為$在雙引號中是特殊的，如果你也想鎖定行首，那麼添加^或使用grep -x. 所以grep '^>scaffold_3$'或grep -x '>scaffold_3'

（-x是--line-regexp：強制 PATTERN 只匹配整行）

如果您可以在行尾有空格並且想要忽略任何空格，那麼

grep -e '>scaffold_3[[:space:]]*$' 

將匹配字元串和行尾之間任意數量的可選空格。（並且無論它從哪裡開始，都會接受匹配。）

請注意，如果文件可以具有 Windows 樣式的 CRLF 行結尾，則不>scaffold_3$會這樣做，末尾的 CR 將與模式不匹配。

引用自：https://unix.stackexchange.com/questions/677608