Linux
如何使用 wget/curl 通過命令行下載 ebi fastq 連結
我有大量數據(fastq)要從 ENA 數據庫下載。
Example: ERS076383 ERS012262 ERS160574 ERS349280 etc Link to download via browser: https://www.ebi.ac.uk/ena/data/warehouse/filereport?accession=ERS076383&result=read_run&fields=fastq_ftp&download=txt
現在我將連結以替換 accession= 以下載相應的 txt 然後我將使用 wget 下載與 fastq 關聯的每個 ftp 連結。但我無法通過 wget 下載它。
i tried: wget https://www.ebi.ac.uk/ena/data/warehouse/filereport?accession=ERS076383&result=read_run&fields=fastq_ftp&download=txt [1] 61380 [2] 61381 [3] 61382 Redirecting output to 'wget-log'....
但它不起作用。
您需要將網址放在引號中,如下所示:
wget 'https://www.ebi.ac.uk/ena/data/warehouse/filereport?accession=ERS076383&result=read_run&fields=fastq_ftp&download=txt'
或轉義與號 (
\&
)。