為一堆程序添加路徑

我在“程序”文件夾中有大量程序（samtools、annovar、bra、bedtools 等）。

我已經閱讀了很多關於導出路徑的文章，因此我不需要從我的工作文件夾中辨識程序的整個路徑。但是，它仍然不起作用，我想是因為我正在混合所有內容。

文件夾 variant_effect_predictor 中有一個 perl 腳本，我想從另一個文件夾中評估它，而無需輸入該腳本的整個路徑。

我正在使用 OS X。我添加了~/.profile以下內容：

export PATH=/Users/pics/Desktop/MyDocuments/Programms/ensembl-tools-release-78/scripts/variant_effect_predictor:$PATH

它以某種方式告訴我：

pik:Annotation pic$ perl variant_effect_predictor.pl -custom C0066PH1.H3K4me1.ppqt_macs2_broad_v2.20130819.bed.gz,BED_annotation,BED,overlap,1 -i SNPs_vep_input.txt --cache --force_overwrite --symbol 
Can't open perl script "variant_effect_predictor.pl": No such file or directory

因此，沒有導出或添加路徑。我該如何解決？

當您執行它時，perl variant_effect_predictor.pl您告訴perl執行檔呼叫的腳本variant_effect_predictor.pl位於目前目錄中並執行它。

如果它是chmod +x /Users/pics/Desktop/MyDocuments/Programms/ensembl-tools-release-78/scripts/variant_effect_predictor/variant_effect_predictor.pl可執行文件（重新想要。#!/usr/bin/perl``perl``bash``$PATH

引用自：https://unix.stackexchange.com/questions/188123