在第一個 grep 結果後計算行中的字元，但從計數中刪除新行

問題：

我有多個文本文件 (.fas)，如下所示：

文件 1.fas：

>species1
AICGICVIAGIAIYIAAICG
>species2
AICGIVVYICAGAYICAGCG

文件 2.fas：

>species1
AIG
>species2
GCI

我有興趣計算第二行中的字元數（一個文件中的所有物種都相同，因為它們是對齊的。

我目前的一個班輪：

for i in *.fas; do echo -n "$i," && grep -m 1 -A 1 '>' $i | tail -n 1 | wc -c; done;

這在一定程度上有效，但計算的數字比實際字元數高一個，因為它正在計算換行符。我該如何解決這個問題，所以它只計算不包括換行符的字元數？

電流輸出：

file1.fas,21
file2.fas,4

期望的輸出：

file1.fas,20
file2.fas,3

• | wc -l列印行數。
• | wc -c列印字元數，包括換行符。
• | wc -lc列印兩者（首先是行數）。

所以你可以簡單地減去它們：（寫它而不是|wc -c）

| wc -lc | awk '{print $2 - $1}'

如果您只在一行上列印您的序列，您可以減去 1 而不是換行符的數量。

或者你可以awk只使用，匹配整行併計算它的字元：

| awk '{match("[A-Z]*");print RLENGTH}'

RLENGTH是匹配的長度（這裡是整行）。在這裡，我假設您只使用大寫字母，否則，使用.而不是[A-Z].

在vim（文本編輯器，因此它可能與您的腳本不兼容）上，直覺地選擇您的區域（一行或多行）並執行：

:'<,'>s/[A-Z]*//gn

tr您還可以使用（也適用於多行）刪除換行符：

| tr -d '\n' | wc -c

順便說一句，可能還有很多其他方法可以做到這一點。

引用自：https://unix.stackexchange.com/questions/606403