如何用另一列中的字元串替換另一列指示的位置的一列中的字元

我對生物資訊學相當陌生（這是我的第一篇文章！），我會感謝一些讓我卡住的任務的幫助。

我有一個製表符分隔的數據表，其中包含三列：

AATTCTTGCA 4 [A/T]
AATTCCTTCG 7 [C/T]
AATTCAACAA 2 [T/C]

我想用第三列中的字元串替換第一列中第二列指示的位置的字元，以便輸出為：

AAT[A/T]CTTGCA
AATTCC[C/T]TCG
A[T/C]TTCAACAA

我現在正在學習各種教程，當我有一些（失敗的）命令時會更新我的文章sed/ awk。

提前致謝！

以下awk命令應該完成任務：

awk -F"\t" '{printf "%s%s%s%s",substr($1,1,$2-1),$3,substr($1,$2+1),ORS}' input.txt

該選項-F將欄位分隔符設置為TAB。然後程序將為printf()每一行列印（使用該函式）

• 欄位 1 的子字元串從開始到（但不包括）欄位 2 中指示的字元位置
• 欄位 3 中包含的字元串
• 欄位 1 的其餘部分，從欄位 2 中指示的字元位置開始
• “輸出記錄分隔符”，預設為換行符

從而有效地將指示的字元替換為欄位 3 的內容。

請注意，事後看來，這種顯式格式控制實際上是不必要的，程序可以縮寫為

awk -F"\t" '{print substr($1,1,$2-1) $3 substr($1,$2+1)}' input.txt

警告：程序假定欄位 2 中的字元位置總是合理的，即大於 0 且小於或等於欄位 1 的總長度。如果文件可能損壞，則需要進行更多錯誤檢查。

引用自：https://unix.stackexchange.com/questions/700615